Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Ctdsp2Q8BX07 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Ctdsp2Q8BX07 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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