Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUN5

Smad3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad3Q8BUN5 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smad3Q8BUN5 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smad3Q8BUN5 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smad3Q8BUN5 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smad3Q8BUN5 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smad3Q8BUN5 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smad3Q8BUN5 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smad3Q8BUN5 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smad3Q8BUN5 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smad3Q8BUN5 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smad3Q8BUN5 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smad3Q8BUN5 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smad3Q8BUN5 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smad3Q8BUN5 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smad3Q8BUN5 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smad3Q8BUN5 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smad3Q8BUN5 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smad3Q8BUN5 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smad3Q8BUN5 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smad3Q8BUN5 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Smad3Q8BUN5 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Smad3Q8BUN5 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Smad3Q8BUN5 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Smad3Q8BUN5 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Smad3Q8BUN5 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Smad3Q8BUN5 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smad3Q8BUN5 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smad3Q8BUN5 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smad3Q8BUN5 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smad3Q8BUN5 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smad3Q8BUN5 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smad3Q8BUN5 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smad3Q8BUN5 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Smad3Q8BUN5 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smad3Q8BUN5 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smad3Q8BUN5 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smad3Q8BUN5 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smad3Q8BUN5 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smad3Q8BUN5 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smad3Q8BUN5 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smad3Q8BUN5 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smad3Q8BUN5 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smad3Q8BUN5 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smad3Q8BUN5 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smad3Q8BUN5 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smad3Q8BUN5 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smad3Q8BUN5 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smad3Q8BUN5 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smad3Q8BUN5 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smad3Q8BUN5 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smad3Q8BUN5 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smad3Q8BUN5 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Smad3Q8BUN5 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Smad3Q8BUN5 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smad3Q8BUN5 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smad3Q8BUN5 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smad3Q8BUN5 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Smad3Q8BUN5 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Smad3Q8BUN5 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smad3Q8BUN5 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smad3Q8BUN5 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smad3Q8BUN5 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smad3Q8BUN5 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smad3Q8BUN5 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smad3Q8BUN5 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smad3Q8BUN5 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smad3Q8BUN5 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smad3Q8BUN5 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smad3Q8BUN5 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smad3Q8BUN5 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad3Q8BUN5 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad3Q8BUN5 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad3Q8BUN5 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad3Q8BUN5 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad3Q8BUN5 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad3Q8BUN5 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad3Q8BUN5 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad3Q8BUN5 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad3Q8BUN5 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad3Q8BUN5 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad3Q8BUN5 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad3Q8BUN5 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad3Q8BUN5 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad3Q8BUN5 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad3Q8BUN5 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad3Q8BUN5 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad3Q8BUN5 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad3Q8BUN5 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad3Q8BUN5 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad3Q8BUN5 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad3Q8BUN5 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad3Q8BUN5 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad3Q8BUN5 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad3Q8BUN5 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad3Q8BUN5 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad3Q8BUN5 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad3Q8BUN5 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad3Q8BUN5 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad3Q8BUN5 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad3Q8BUN5 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms