Protein–RNA interactions for Protein: Q8BRE0

Rd3, Protein RD3, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3Q8BRE0 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms