Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLY1

Smoc1, SPARC-related modular calcium-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smoc1Q8BLY1 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smoc1Q8BLY1 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smoc1Q8BLY1 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smoc1Q8BLY1 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smoc1Q8BLY1 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smoc1Q8BLY1 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smoc1Q8BLY1 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smoc1Q8BLY1 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smoc1Q8BLY1 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smoc1Q8BLY1 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Smoc1Q8BLY1 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smoc1Q8BLY1 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smoc1Q8BLY1 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smoc1Q8BLY1 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Smoc1Q8BLY1 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Smoc1Q8BLY1 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smoc1Q8BLY1 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Smoc1Q8BLY1 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smoc1Q8BLY1 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smoc1Q8BLY1 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smoc1Q8BLY1 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smoc1Q8BLY1 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smoc1Q8BLY1 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smoc1Q8BLY1 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smoc1Q8BLY1 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smoc1Q8BLY1 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smoc1Q8BLY1 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smoc1Q8BLY1 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Smoc1Q8BLY1 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smoc1Q8BLY1 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smoc1Q8BLY1 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smoc1Q8BLY1 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smoc1Q8BLY1 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smoc1Q8BLY1 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smoc1Q8BLY1 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smoc1Q8BLY1 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Smoc1Q8BLY1 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smoc1Q8BLY1 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smoc1Q8BLY1 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smoc1Q8BLY1 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smoc1Q8BLY1 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smoc1Q8BLY1 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Smoc1Q8BLY1 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smoc1Q8BLY1 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Smoc1Q8BLY1 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smoc1Q8BLY1 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Smoc1Q8BLY1 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Smoc1Q8BLY1 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Smoc1Q8BLY1 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smoc1Q8BLY1 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Smoc1Q8BLY1 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Smoc1Q8BLY1 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.07■□□□□ 0
Smoc1Q8BLY1 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Smoc1Q8BLY1 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smoc1Q8BLY1 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smoc1Q8BLY1 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smoc1Q8BLY1 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smoc1Q8BLY1 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smoc1Q8BLY1 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smoc1Q8BLY1 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smoc1Q8BLY1 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smoc1Q8BLY1 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smoc1Q8BLY1 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smoc1Q8BLY1 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smoc1Q8BLY1 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smoc1Q8BLY1 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smoc1Q8BLY1 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smoc1Q8BLY1 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smoc1Q8BLY1 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smoc1Q8BLY1 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smoc1Q8BLY1 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smoc1Q8BLY1 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smoc1Q8BLY1 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smoc1Q8BLY1 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smoc1Q8BLY1 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smoc1Q8BLY1 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Smoc1Q8BLY1 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smoc1Q8BLY1 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smoc1Q8BLY1 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smoc1Q8BLY1 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smoc1Q8BLY1 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Smoc1Q8BLY1 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smoc1Q8BLY1 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smoc1Q8BLY1 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Smoc1Q8BLY1 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Smoc1Q8BLY1 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smoc1Q8BLY1 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Smoc1Q8BLY1 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smoc1Q8BLY1 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smoc1Q8BLY1 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smoc1Q8BLY1 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smoc1Q8BLY1 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smoc1Q8BLY1 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smoc1Q8BLY1 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smoc1Q8BLY1 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Smoc1Q8BLY1 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smoc1Q8BLY1 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smoc1Q8BLY1 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smoc1Q8BLY1 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smoc1Q8BLY1 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.4 ms