Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKN5

Tubgcp5, Gamma-tubulin complex component 5, mousemouse

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Length 1,024 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp5Q8BKN5 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tubgcp5Q8BKN5 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tubgcp5Q8BKN5 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Tubgcp5Q8BKN5 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tubgcp5Q8BKN5 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tubgcp5Q8BKN5 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Tubgcp5Q8BKN5 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tubgcp5Q8BKN5 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tubgcp5Q8BKN5 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tubgcp5Q8BKN5 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tubgcp5Q8BKN5 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tubgcp5Q8BKN5 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tubgcp5Q8BKN5 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tubgcp5Q8BKN5 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tubgcp5Q8BKN5 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tubgcp5Q8BKN5 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tubgcp5Q8BKN5 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tubgcp5Q8BKN5 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tubgcp5Q8BKN5 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tubgcp5Q8BKN5 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tubgcp5Q8BKN5 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tubgcp5Q8BKN5 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tubgcp5Q8BKN5 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tubgcp5Q8BKN5 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tubgcp5Q8BKN5 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tubgcp5Q8BKN5 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tubgcp5Q8BKN5 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Tubgcp5Q8BKN5 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Tubgcp5Q8BKN5 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Tubgcp5Q8BKN5 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tubgcp5Q8BKN5 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Tubgcp5Q8BKN5 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tubgcp5Q8BKN5 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tubgcp5Q8BKN5 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tubgcp5Q8BKN5 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Tubgcp5Q8BKN5 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tubgcp5Q8BKN5 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Tubgcp5Q8BKN5 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tubgcp5Q8BKN5 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tubgcp5Q8BKN5 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tubgcp5Q8BKN5 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tubgcp5Q8BKN5 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tubgcp5Q8BKN5 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Tubgcp5Q8BKN5 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tubgcp5Q8BKN5 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tubgcp5Q8BKN5 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tubgcp5Q8BKN5 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Tubgcp5Q8BKN5 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tubgcp5Q8BKN5 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tubgcp5Q8BKN5 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tubgcp5Q8BKN5 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tubgcp5Q8BKN5 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tubgcp5Q8BKN5 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tubgcp5Q8BKN5 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tubgcp5Q8BKN5 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tubgcp5Q8BKN5 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tubgcp5Q8BKN5 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tubgcp5Q8BKN5 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tubgcp5Q8BKN5 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tubgcp5Q8BKN5 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tubgcp5Q8BKN5 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tubgcp5Q8BKN5 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tubgcp5Q8BKN5 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tubgcp5Q8BKN5 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tubgcp5Q8BKN5 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tubgcp5Q8BKN5 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tubgcp5Q8BKN5 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tubgcp5Q8BKN5 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tubgcp5Q8BKN5 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Tubgcp5Q8BKN5 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tubgcp5Q8BKN5 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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