Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
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Atg4dQ8BGV9 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Atg4dQ8BGV9 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Atg4dQ8BGV9 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Atg4dQ8BGV9 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Atg4dQ8BGV9 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Atg4dQ8BGV9 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Atg4dQ8BGV9 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Atg4dQ8BGV9 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Atg4dQ8BGV9 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Atg4dQ8BGV9 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Atg4dQ8BGV9 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Atg4dQ8BGV9 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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