Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE7

Trim6, Tripartite motif-containing protein 6, mousemouse

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Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim6Q8BGE7 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms