Protein–RNA interactions for Protein: Q810L4

Tmem39b, Transmembrane protein 39B, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem39bQ810L4 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem39bQ810L4 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem39bQ810L4 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem39bQ810L4 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem39bQ810L4 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem39bQ810L4 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem39bQ810L4 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem39bQ810L4 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem39bQ810L4 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem39bQ810L4 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem39bQ810L4 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem39bQ810L4 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem39bQ810L4 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem39bQ810L4 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem39bQ810L4 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem39bQ810L4 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem39bQ810L4 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem39bQ810L4 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem39bQ810L4 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem39bQ810L4 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem39bQ810L4 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem39bQ810L4 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem39bQ810L4 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem39bQ810L4 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem39bQ810L4 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem39bQ810L4 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem39bQ810L4 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem39bQ810L4 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem39bQ810L4 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem39bQ810L4 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem39bQ810L4 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem39bQ810L4 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem39bQ810L4 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem39bQ810L4 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem39bQ810L4 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem39bQ810L4 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem39bQ810L4 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem39bQ810L4 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem39bQ810L4 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem39bQ810L4 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem39bQ810L4 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem39bQ810L4 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem39bQ810L4 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem39bQ810L4 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem39bQ810L4 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem39bQ810L4 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem39bQ810L4 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem39bQ810L4 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem39bQ810L4 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem39bQ810L4 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem39bQ810L4 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem39bQ810L4 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem39bQ810L4 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem39bQ810L4 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem39bQ810L4 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem39bQ810L4 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem39bQ810L4 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem39bQ810L4 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem39bQ810L4 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem39bQ810L4 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem39bQ810L4 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem39bQ810L4 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem39bQ810L4 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem39bQ810L4 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem39bQ810L4 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem39bQ810L4 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem39bQ810L4 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem39bQ810L4 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem39bQ810L4 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem39bQ810L4 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem39bQ810L4 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem39bQ810L4 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem39bQ810L4 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem39bQ810L4 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem39bQ810L4 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem39bQ810L4 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem39bQ810L4 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem39bQ810L4 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem39bQ810L4 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tmem39bQ810L4 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tmem39bQ810L4 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tmem39bQ810L4 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem39bQ810L4 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem39bQ810L4 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem39bQ810L4 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem39bQ810L4 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem39bQ810L4 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem39bQ810L4 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem39bQ810L4 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem39bQ810L4 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem39bQ810L4 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem39bQ810L4 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem39bQ810L4 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem39bQ810L4 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem39bQ810L4 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem39bQ810L4 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem39bQ810L4 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem39bQ810L4 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem39bQ810L4 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem39bQ810L4 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms