Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms