Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Zbed4Q80WQ9 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zbed4Q80WQ9 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zbed4Q80WQ9 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zbed4Q80WQ9 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zbed4Q80WQ9 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zbed4Q80WQ9 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Zbed4Q80WQ9 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zbed4Q80WQ9 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zbed4Q80WQ9 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zbed4Q80WQ9 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zbed4Q80WQ9 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zbed4Q80WQ9 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zbed4Q80WQ9 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Zbed4Q80WQ9 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zbed4Q80WQ9 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zbed4Q80WQ9 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zbed4Q80WQ9 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Zbed4Q80WQ9 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Zbed4Q80WQ9 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Zbed4Q80WQ9 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Zbed4Q80WQ9 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Zbed4Q80WQ9 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zbed4Q80WQ9 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zbed4Q80WQ9 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Zbed4Q80WQ9 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zbed4Q80WQ9 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zbed4Q80WQ9 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zbed4Q80WQ9 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zbed4Q80WQ9 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zbed4Q80WQ9 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zbed4Q80WQ9 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zbed4Q80WQ9 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zbed4Q80WQ9 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zbed4Q80WQ9 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zbed4Q80WQ9 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zbed4Q80WQ9 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zbed4Q80WQ9 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms