Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
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Pcsk9Q80W65 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pcsk9Q80W65 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pcsk9Q80W65 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pcsk9Q80W65 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Pcsk9Q80W65 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Pcsk9Q80W65 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pcsk9Q80W65 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Pcsk9Q80W65 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Pcsk9Q80W65 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pcsk9Q80W65 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Pcsk9Q80W65 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pcsk9Q80W65 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pcsk9Q80W65 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pcsk9Q80W65 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Pcsk9Q80W65 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pcsk9Q80W65 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pcsk9Q80W65 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pcsk9Q80W65 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pcsk9Q80W65 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pcsk9Q80W65 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pcsk9Q80W65 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Pcsk9Q80W65 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pcsk9Q80W65 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pcsk9Q80W65 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Pcsk9Q80W65 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pcsk9Q80W65 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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