Protein–RNA interactions for Protein: Q80VU4

Ntf4, Neurotrophin-4, mousemouse

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Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf4Q80VU4 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Ntf4Q80VU4 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ntf4Q80VU4 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Ntf4Q80VU4 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Ntf4Q80VU4 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ntf4Q80VU4 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ntf4Q80VU4 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ntf4Q80VU4 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Ntf4Q80VU4 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ntf4Q80VU4 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Ntf4Q80VU4 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ntf4Q80VU4 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ntf4Q80VU4 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ntf4Q80VU4 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Ntf4Q80VU4 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ntf4Q80VU4 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Ntf4Q80VU4 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Ntf4Q80VU4 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Ntf4Q80VU4 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Ntf4Q80VU4 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Ntf4Q80VU4 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ntf4Q80VU4 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ntf4Q80VU4 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Ntf4Q80VU4 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ntf4Q80VU4 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Ntf4Q80VU4 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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