Protein–RNA interactions for Protein: Q80UW2

Fbxo2, F-box only protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo2Q80UW2 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fbxo2Q80UW2 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fbxo2Q80UW2 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fbxo2Q80UW2 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fbxo2Q80UW2 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Fbxo2Q80UW2 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Fbxo2Q80UW2 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fbxo2Q80UW2 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fbxo2Q80UW2 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fbxo2Q80UW2 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fbxo2Q80UW2 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fbxo2Q80UW2 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fbxo2Q80UW2 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fbxo2Q80UW2 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fbxo2Q80UW2 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fbxo2Q80UW2 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fbxo2Q80UW2 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fbxo2Q80UW2 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fbxo2Q80UW2 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fbxo2Q80UW2 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fbxo2Q80UW2 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fbxo2Q80UW2 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fbxo2Q80UW2 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxo2Q80UW2 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxo2Q80UW2 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxo2Q80UW2 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxo2Q80UW2 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxo2Q80UW2 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxo2Q80UW2 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxo2Q80UW2 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxo2Q80UW2 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxo2Q80UW2 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxo2Q80UW2 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxo2Q80UW2 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxo2Q80UW2 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxo2Q80UW2 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxo2Q80UW2 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxo2Q80UW2 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxo2Q80UW2 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxo2Q80UW2 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxo2Q80UW2 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxo2Q80UW2 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxo2Q80UW2 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxo2Q80UW2 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxo2Q80UW2 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxo2Q80UW2 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxo2Q80UW2 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxo2Q80UW2 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxo2Q80UW2 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxo2Q80UW2 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxo2Q80UW2 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxo2Q80UW2 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxo2Q80UW2 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxo2Q80UW2 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxo2Q80UW2 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxo2Q80UW2 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxo2Q80UW2 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxo2Q80UW2 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxo2Q80UW2 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxo2Q80UW2 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxo2Q80UW2 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxo2Q80UW2 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxo2Q80UW2 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxo2Q80UW2 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxo2Q80UW2 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxo2Q80UW2 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxo2Q80UW2 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxo2Q80UW2 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxo2Q80UW2 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxo2Q80UW2 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxo2Q80UW2 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxo2Q80UW2 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxo2Q80UW2 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxo2Q80UW2 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxo2Q80UW2 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxo2Q80UW2 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fbxo2Q80UW2 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fbxo2Q80UW2 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fbxo2Q80UW2 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fbxo2Q80UW2 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fbxo2Q80UW2 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fbxo2Q80UW2 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fbxo2Q80UW2 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fbxo2Q80UW2 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fbxo2Q80UW2 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Fbxo2Q80UW2 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fbxo2Q80UW2 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fbxo2Q80UW2 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fbxo2Q80UW2 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fbxo2Q80UW2 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fbxo2Q80UW2 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fbxo2Q80UW2 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fbxo2Q80UW2 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fbxo2Q80UW2 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fbxo2Q80UW2 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fbxo2Q80UW2 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fbxo2Q80UW2 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fbxo2Q80UW2 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fbxo2Q80UW2 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fbxo2Q80UW2 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms