Protein–RNA interactions for Protein: Q80UK0

Sestd1, SEC14 domain and spectrin repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sestd1Q80UK0 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sestd1Q80UK0 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms