Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NischQ80TM9 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NischQ80TM9 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NischQ80TM9 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NischQ80TM9 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NischQ80TM9 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NischQ80TM9 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NischQ80TM9 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NischQ80TM9 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NischQ80TM9 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NischQ80TM9 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NischQ80TM9 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NischQ80TM9 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NischQ80TM9 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NischQ80TM9 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NischQ80TM9 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
NischQ80TM9 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
NischQ80TM9 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
NischQ80TM9 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
NischQ80TM9 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NischQ80TM9 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NischQ80TM9 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NischQ80TM9 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NischQ80TM9 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NischQ80TM9 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NischQ80TM9 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NischQ80TM9 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NischQ80TM9 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
NischQ80TM9 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NischQ80TM9 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NischQ80TM9 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
NischQ80TM9 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NischQ80TM9 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NischQ80TM9 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NischQ80TM9 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NischQ80TM9 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NischQ80TM9 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NischQ80TM9 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NischQ80TM9 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
NischQ80TM9 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NischQ80TM9 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NischQ80TM9 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NischQ80TM9 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NischQ80TM9 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NischQ80TM9 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
NischQ80TM9 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NischQ80TM9 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NischQ80TM9 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
NischQ80TM9 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
NischQ80TM9 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
NischQ80TM9 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NischQ80TM9 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NischQ80TM9 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NischQ80TM9 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NischQ80TM9 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NischQ80TM9 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
NischQ80TM9 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NischQ80TM9 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NischQ80TM9 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NischQ80TM9 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
NischQ80TM9 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
NischQ80TM9 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NischQ80TM9 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NischQ80TM9 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
NischQ80TM9 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
NischQ80TM9 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
NischQ80TM9 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NischQ80TM9 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NischQ80TM9 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
NischQ80TM9 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NischQ80TM9 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NischQ80TM9 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
NischQ80TM9 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NischQ80TM9 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NischQ80TM9 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NischQ80TM9 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NischQ80TM9 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
NischQ80TM9 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
NischQ80TM9 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NischQ80TM9 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NischQ80TM9 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
NischQ80TM9 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NischQ80TM9 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NischQ80TM9 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NischQ80TM9 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NischQ80TM9 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NischQ80TM9 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NischQ80TM9 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NischQ80TM9 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NischQ80TM9 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NischQ80TM9 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NischQ80TM9 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NischQ80TM9 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NischQ80TM9 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NischQ80TM9 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NischQ80TM9 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NischQ80TM9 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NischQ80TM9 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NischQ80TM9 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NischQ80TM9 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
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