Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSY8

Sgo2, Shugoshin 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo2Q7TSY8 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sgo2Q7TSY8 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sgo2Q7TSY8 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sgo2Q7TSY8 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sgo2Q7TSY8 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sgo2Q7TSY8 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sgo2Q7TSY8 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sgo2Q7TSY8 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sgo2Q7TSY8 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sgo2Q7TSY8 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sgo2Q7TSY8 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sgo2Q7TSY8 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sgo2Q7TSY8 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sgo2Q7TSY8 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sgo2Q7TSY8 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sgo2Q7TSY8 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sgo2Q7TSY8 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sgo2Q7TSY8 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sgo2Q7TSY8 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sgo2Q7TSY8 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sgo2Q7TSY8 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sgo2Q7TSY8 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sgo2Q7TSY8 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sgo2Q7TSY8 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sgo2Q7TSY8 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sgo2Q7TSY8 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sgo2Q7TSY8 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sgo2Q7TSY8 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sgo2Q7TSY8 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sgo2Q7TSY8 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sgo2Q7TSY8 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sgo2Q7TSY8 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sgo2Q7TSY8 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sgo2Q7TSY8 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sgo2Q7TSY8 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sgo2Q7TSY8 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sgo2Q7TSY8 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sgo2Q7TSY8 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sgo2Q7TSY8 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sgo2Q7TSY8 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sgo2Q7TSY8 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sgo2Q7TSY8 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sgo2Q7TSY8 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sgo2Q7TSY8 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sgo2Q7TSY8 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sgo2Q7TSY8 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sgo2Q7TSY8 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sgo2Q7TSY8 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sgo2Q7TSY8 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sgo2Q7TSY8 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sgo2Q7TSY8 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sgo2Q7TSY8 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sgo2Q7TSY8 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sgo2Q7TSY8 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sgo2Q7TSY8 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sgo2Q7TSY8 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sgo2Q7TSY8 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sgo2Q7TSY8 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sgo2Q7TSY8 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sgo2Q7TSY8 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sgo2Q7TSY8 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sgo2Q7TSY8 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sgo2Q7TSY8 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sgo2Q7TSY8 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sgo2Q7TSY8 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sgo2Q7TSY8 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sgo2Q7TSY8 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sgo2Q7TSY8 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sgo2Q7TSY8 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sgo2Q7TSY8 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sgo2Q7TSY8 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sgo2Q7TSY8 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sgo2Q7TSY8 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sgo2Q7TSY8 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sgo2Q7TSY8 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sgo2Q7TSY8 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sgo2Q7TSY8 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sgo2Q7TSY8 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sgo2Q7TSY8 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sgo2Q7TSY8 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sgo2Q7TSY8 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sgo2Q7TSY8 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Sgo2Q7TSY8 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sgo2Q7TSY8 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sgo2Q7TSY8 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sgo2Q7TSY8 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sgo2Q7TSY8 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sgo2Q7TSY8 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sgo2Q7TSY8 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sgo2Q7TSY8 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sgo2Q7TSY8 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sgo2Q7TSY8 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Sgo2Q7TSY8 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Sgo2Q7TSY8 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sgo2Q7TSY8 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sgo2Q7TSY8 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sgo2Q7TSY8 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sgo2Q7TSY8 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sgo2Q7TSY8 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sgo2Q7TSY8 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms