Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNB8

Sbno2, Protein strawberry notch homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno2Q7TNB8 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms