Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Shq1Q7TMX5 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Shq1Q7TMX5 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Shq1Q7TMX5 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Shq1Q7TMX5 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Shq1Q7TMX5 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Shq1Q7TMX5 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Shq1Q7TMX5 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Shq1Q7TMX5 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Shq1Q7TMX5 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Shq1Q7TMX5 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Shq1Q7TMX5 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Shq1Q7TMX5 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Shq1Q7TMX5 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Shq1Q7TMX5 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Shq1Q7TMX5 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Shq1Q7TMX5 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Shq1Q7TMX5 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Shq1Q7TMX5 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Shq1Q7TMX5 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Shq1Q7TMX5 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Shq1Q7TMX5 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Shq1Q7TMX5 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Shq1Q7TMX5 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Shq1Q7TMX5 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Shq1Q7TMX5 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Shq1Q7TMX5 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Shq1Q7TMX5 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Shq1Q7TMX5 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Shq1Q7TMX5 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Shq1Q7TMX5 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Shq1Q7TMX5 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Shq1Q7TMX5 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Shq1Q7TMX5 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Shq1Q7TMX5 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Shq1Q7TMX5 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Shq1Q7TMX5 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Shq1Q7TMX5 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Shq1Q7TMX5 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Shq1Q7TMX5 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Shq1Q7TMX5 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Shq1Q7TMX5 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Shq1Q7TMX5 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Shq1Q7TMX5 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Shq1Q7TMX5 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Shq1Q7TMX5 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Shq1Q7TMX5 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Shq1Q7TMX5 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Shq1Q7TMX5 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Shq1Q7TMX5 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Shq1Q7TMX5 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Shq1Q7TMX5 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Shq1Q7TMX5 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Shq1Q7TMX5 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Shq1Q7TMX5 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Shq1Q7TMX5 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Shq1Q7TMX5 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Shq1Q7TMX5 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Shq1Q7TMX5 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Shq1Q7TMX5 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Shq1Q7TMX5 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Shq1Q7TMX5 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Shq1Q7TMX5 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Shq1Q7TMX5 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Shq1Q7TMX5 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Shq1Q7TMX5 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Shq1Q7TMX5 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Shq1Q7TMX5 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Shq1Q7TMX5 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Shq1Q7TMX5 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Shq1Q7TMX5 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Shq1Q7TMX5 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Shq1Q7TMX5 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Shq1Q7TMX5 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Shq1Q7TMX5 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Shq1Q7TMX5 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Shq1Q7TMX5 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Shq1Q7TMX5 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Shq1Q7TMX5 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Shq1Q7TMX5 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Shq1Q7TMX5 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Shq1Q7TMX5 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Shq1Q7TMX5 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Shq1Q7TMX5 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Shq1Q7TMX5 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Shq1Q7TMX5 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Shq1Q7TMX5 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Shq1Q7TMX5 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Shq1Q7TMX5 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Shq1Q7TMX5 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Shq1Q7TMX5 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Shq1Q7TMX5 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Shq1Q7TMX5 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Shq1Q7TMX5 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Shq1Q7TMX5 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Shq1Q7TMX5 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Shq1Q7TMX5 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Shq1Q7TMX5 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Shq1Q7TMX5 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Shq1Q7TMX5 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms