Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMI3

Uhrf2, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF2, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf2Q7TMI3 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Uhrf2Q7TMI3 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Uhrf2Q7TMI3 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Uhrf2Q7TMI3 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Uhrf2Q7TMI3 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Uhrf2Q7TMI3 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Uhrf2Q7TMI3 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Uhrf2Q7TMI3 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Uhrf2Q7TMI3 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Uhrf2Q7TMI3 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Uhrf2Q7TMI3 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Uhrf2Q7TMI3 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Uhrf2Q7TMI3 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Uhrf2Q7TMI3 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Uhrf2Q7TMI3 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Uhrf2Q7TMI3 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Uhrf2Q7TMI3 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Uhrf2Q7TMI3 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Uhrf2Q7TMI3 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Uhrf2Q7TMI3 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Uhrf2Q7TMI3 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Uhrf2Q7TMI3 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Uhrf2Q7TMI3 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Uhrf2Q7TMI3 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Uhrf2Q7TMI3 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Uhrf2Q7TMI3 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Uhrf2Q7TMI3 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Uhrf2Q7TMI3 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Uhrf2Q7TMI3 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Uhrf2Q7TMI3 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Uhrf2Q7TMI3 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Uhrf2Q7TMI3 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Uhrf2Q7TMI3 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Uhrf2Q7TMI3 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Uhrf2Q7TMI3 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Uhrf2Q7TMI3 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Uhrf2Q7TMI3 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Uhrf2Q7TMI3 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Uhrf2Q7TMI3 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Uhrf2Q7TMI3 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Uhrf2Q7TMI3 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Uhrf2Q7TMI3 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Uhrf2Q7TMI3 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Uhrf2Q7TMI3 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Uhrf2Q7TMI3 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Uhrf2Q7TMI3 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Uhrf2Q7TMI3 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Uhrf2Q7TMI3 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Uhrf2Q7TMI3 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Uhrf2Q7TMI3 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Uhrf2Q7TMI3 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Uhrf2Q7TMI3 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Uhrf2Q7TMI3 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Uhrf2Q7TMI3 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Uhrf2Q7TMI3 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Uhrf2Q7TMI3 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Uhrf2Q7TMI3 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Uhrf2Q7TMI3 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Uhrf2Q7TMI3 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Uhrf2Q7TMI3 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Uhrf2Q7TMI3 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Uhrf2Q7TMI3 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Uhrf2Q7TMI3 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Uhrf2Q7TMI3 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Uhrf2Q7TMI3 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Uhrf2Q7TMI3 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Uhrf2Q7TMI3 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Uhrf2Q7TMI3 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Uhrf2Q7TMI3 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Uhrf2Q7TMI3 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Uhrf2Q7TMI3 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Uhrf2Q7TMI3 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Uhrf2Q7TMI3 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Uhrf2Q7TMI3 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Uhrf2Q7TMI3 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Uhrf2Q7TMI3 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Uhrf2Q7TMI3 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Uhrf2Q7TMI3 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Uhrf2Q7TMI3 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Uhrf2Q7TMI3 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Uhrf2Q7TMI3 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Uhrf2Q7TMI3 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Uhrf2Q7TMI3 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Uhrf2Q7TMI3 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Uhrf2Q7TMI3 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Uhrf2Q7TMI3 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Uhrf2Q7TMI3 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Uhrf2Q7TMI3 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Uhrf2Q7TMI3 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Uhrf2Q7TMI3 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Uhrf2Q7TMI3 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Uhrf2Q7TMI3 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Uhrf2Q7TMI3 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Uhrf2Q7TMI3 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Uhrf2Q7TMI3 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Uhrf2Q7TMI3 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Uhrf2Q7TMI3 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Uhrf2Q7TMI3 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Uhrf2Q7TMI3 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms