Protein–RNA interactions for Protein: Q78T54

Vma21, Vacuolar ATPase assembly integral membrane protein Vma21, mousemouse

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Length 101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vma21Q78T54 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vma21Q78T54 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vma21Q78T54 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vma21Q78T54 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vma21Q78T54 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vma21Q78T54 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vma21Q78T54 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vma21Q78T54 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vma21Q78T54 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vma21Q78T54 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vma21Q78T54 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vma21Q78T54 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vma21Q78T54 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vma21Q78T54 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vma21Q78T54 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vma21Q78T54 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vma21Q78T54 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vma21Q78T54 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vma21Q78T54 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vma21Q78T54 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vma21Q78T54 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vma21Q78T54 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vma21Q78T54 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vma21Q78T54 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vma21Q78T54 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Vma21Q78T54 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vma21Q78T54 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vma21Q78T54 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vma21Q78T54 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Vma21Q78T54 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vma21Q78T54 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vma21Q78T54 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vma21Q78T54 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Vma21Q78T54 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vma21Q78T54 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Vma21Q78T54 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vma21Q78T54 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vma21Q78T54 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vma21Q78T54 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vma21Q78T54 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vma21Q78T54 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vma21Q78T54 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Vma21Q78T54 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Vma21Q78T54 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vma21Q78T54 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Vma21Q78T54 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vma21Q78T54 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Vma21Q78T54 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Vma21Q78T54 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vma21Q78T54 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vma21Q78T54 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vma21Q78T54 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vma21Q78T54 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vma21Q78T54 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vma21Q78T54 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vma21Q78T54 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Vma21Q78T54 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vma21Q78T54 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vma21Q78T54 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vma21Q78T54 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vma21Q78T54 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Vma21Q78T54 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vma21Q78T54 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vma21Q78T54 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vma21Q78T54 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vma21Q78T54 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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