Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS8

Spop, Speckle-type POZ protein, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpopQ6ZWS8 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms