Protein–RNA interactions for Protein: Q6XVG2

Cyp2c54, Cytochrome P450 2C54, mousemouse

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Length 490 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2c54Q6XVG2 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp2c54Q6XVG2 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp2c54Q6XVG2 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp2c54Q6XVG2 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp2c54Q6XVG2 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp2c54Q6XVG2 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp2c54Q6XVG2 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp2c54Q6XVG2 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp2c54Q6XVG2 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp2c54Q6XVG2 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp2c54Q6XVG2 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp2c54Q6XVG2 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp2c54Q6XVG2 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp2c54Q6XVG2 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cyp2c54Q6XVG2 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cyp2c54Q6XVG2 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp2c54Q6XVG2 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp2c54Q6XVG2 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp2c54Q6XVG2 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp2c54Q6XVG2 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp2c54Q6XVG2 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp2c54Q6XVG2 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp2c54Q6XVG2 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp2c54Q6XVG2 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp2c54Q6XVG2 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp2c54Q6XVG2 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp2c54Q6XVG2 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp2c54Q6XVG2 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp2c54Q6XVG2 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp2c54Q6XVG2 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp2c54Q6XVG2 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp2c54Q6XVG2 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp2c54Q6XVG2 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp2c54Q6XVG2 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp2c54Q6XVG2 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Cyp2c54Q6XVG2 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp2c54Q6XVG2 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp2c54Q6XVG2 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp2c54Q6XVG2 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp2c54Q6XVG2 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp2c54Q6XVG2 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp2c54Q6XVG2 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Cyp2c54Q6XVG2 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp2c54Q6XVG2 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp2c54Q6XVG2 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp2c54Q6XVG2 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp2c54Q6XVG2 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp2c54Q6XVG2 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp2c54Q6XVG2 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Cyp2c54Q6XVG2 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Cyp2c54Q6XVG2 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp2c54Q6XVG2 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp2c54Q6XVG2 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Cyp2c54Q6XVG2 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp2c54Q6XVG2 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Cyp2c54Q6XVG2 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Cyp2c54Q6XVG2 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Cyp2c54Q6XVG2 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp2c54Q6XVG2 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp2c54Q6XVG2 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp2c54Q6XVG2 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp2c54Q6XVG2 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp2c54Q6XVG2 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp2c54Q6XVG2 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Cyp2c54Q6XVG2 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp2c54Q6XVG2 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp2c54Q6XVG2 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp2c54Q6XVG2 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyp2c54Q6XVG2 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyp2c54Q6XVG2 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyp2c54Q6XVG2 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyp2c54Q6XVG2 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyp2c54Q6XVG2 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyp2c54Q6XVG2 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyp2c54Q6XVG2 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyp2c54Q6XVG2 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyp2c54Q6XVG2 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyp2c54Q6XVG2 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Cyp2c54Q6XVG2 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyp2c54Q6XVG2 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyp2c54Q6XVG2 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyp2c54Q6XVG2 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyp2c54Q6XVG2 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyp2c54Q6XVG2 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyp2c54Q6XVG2 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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