Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUT8

Ccdc154, Coiled-coil domain-containing protein 154, mousemouse

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Length 657 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc154Q6RUT8 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc154Q6RUT8 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc154Q6RUT8 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc154Q6RUT8 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Ccdc154Q6RUT8 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc154Q6RUT8 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Ccdc154Q6RUT8 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Ccdc154Q6RUT8 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Ccdc154Q6RUT8 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Ccdc154Q6RUT8 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Ccdc154Q6RUT8 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Ccdc154Q6RUT8 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Ccdc154Q6RUT8 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc154Q6RUT8 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc154Q6RUT8 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc154Q6RUT8 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc154Q6RUT8 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc154Q6RUT8 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc154Q6RUT8 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc154Q6RUT8 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc154Q6RUT8 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc154Q6RUT8 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc154Q6RUT8 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc154Q6RUT8 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc154Q6RUT8 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc154Q6RUT8 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc154Q6RUT8 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc154Q6RUT8 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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