Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE3

Rad54b, DNA repair and recombination protein RAD54B, mousemouse

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Length 886 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54bQ6PFE3 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Rad54bQ6PFE3 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Rad54bQ6PFE3 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Rad54bQ6PFE3 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Rad54bQ6PFE3 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Rad54bQ6PFE3 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Rad54bQ6PFE3 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Rad54bQ6PFE3 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Rad54bQ6PFE3 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Rad54bQ6PFE3 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
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Rad54bQ6PFE3 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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