Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDY0

Ccdc85b, Coiled-coil domain-containing protein 85B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85bQ6PDY0 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc85bQ6PDY0 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc85bQ6PDY0 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc85bQ6PDY0 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc85bQ6PDY0 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc85bQ6PDY0 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc85bQ6PDY0 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc85bQ6PDY0 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc85bQ6PDY0 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc85bQ6PDY0 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc85bQ6PDY0 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc85bQ6PDY0 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc85bQ6PDY0 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc85bQ6PDY0 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc85bQ6PDY0 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc85bQ6PDY0 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc85bQ6PDY0 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc85bQ6PDY0 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc85bQ6PDY0 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc85bQ6PDY0 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc85bQ6PDY0 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc85bQ6PDY0 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc85bQ6PDY0 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc85bQ6PDY0 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc85bQ6PDY0 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc85bQ6PDY0 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc85bQ6PDY0 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc85bQ6PDY0 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc85bQ6PDY0 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc85bQ6PDY0 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc85bQ6PDY0 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc85bQ6PDY0 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc85bQ6PDY0 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc85bQ6PDY0 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc85bQ6PDY0 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc85bQ6PDY0 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc85bQ6PDY0 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc85bQ6PDY0 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc85bQ6PDY0 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc85bQ6PDY0 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc85bQ6PDY0 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc85bQ6PDY0 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc85bQ6PDY0 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc85bQ6PDY0 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc85bQ6PDY0 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc85bQ6PDY0 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc85bQ6PDY0 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc85bQ6PDY0 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc85bQ6PDY0 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc85bQ6PDY0 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc85bQ6PDY0 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc85bQ6PDY0 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc85bQ6PDY0 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc85bQ6PDY0 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc85bQ6PDY0 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc85bQ6PDY0 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc85bQ6PDY0 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc85bQ6PDY0 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc85bQ6PDY0 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc85bQ6PDY0 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc85bQ6PDY0 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc85bQ6PDY0 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc85bQ6PDY0 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc85bQ6PDY0 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc85bQ6PDY0 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc85bQ6PDY0 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc85bQ6PDY0 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc85bQ6PDY0 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc85bQ6PDY0 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc85bQ6PDY0 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc85bQ6PDY0 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc85bQ6PDY0 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc85bQ6PDY0 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc85bQ6PDY0 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc85bQ6PDY0 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc85bQ6PDY0 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc85bQ6PDY0 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc85bQ6PDY0 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc85bQ6PDY0 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc85bQ6PDY0 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc85bQ6PDY0 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc85bQ6PDY0 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc85bQ6PDY0 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc85bQ6PDY0 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc85bQ6PDY0 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc85bQ6PDY0 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc85bQ6PDY0 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc85bQ6PDY0 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc85bQ6PDY0 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc85bQ6PDY0 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc85bQ6PDY0 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc85bQ6PDY0 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms