Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDE8

Mfsd13a, Transmembrane protein 180, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd13aQ6PDE8 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms