Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zbtb40Q6PCS8 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zbtb40Q6PCS8 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zbtb40Q6PCS8 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zbtb40Q6PCS8 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Zbtb40Q6PCS8 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zbtb40Q6PCS8 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Zbtb40Q6PCS8 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zbtb40Q6PCS8 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zbtb40Q6PCS8 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zbtb40Q6PCS8 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zbtb40Q6PCS8 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zbtb40Q6PCS8 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zbtb40Q6PCS8 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zbtb40Q6PCS8 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zbtb40Q6PCS8 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zbtb40Q6PCS8 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zbtb40Q6PCS8 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zbtb40Q6PCS8 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zbtb40Q6PCS8 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zbtb40Q6PCS8 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zbtb40Q6PCS8 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zbtb40Q6PCS8 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zbtb40Q6PCS8 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zbtb40Q6PCS8 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zbtb40Q6PCS8 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zbtb40Q6PCS8 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zbtb40Q6PCS8 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zbtb40Q6PCS8 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Zbtb40Q6PCS8 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zbtb40Q6PCS8 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zbtb40Q6PCS8 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zbtb40Q6PCS8 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zbtb40Q6PCS8 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zbtb40Q6PCS8 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Zbtb40Q6PCS8 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zbtb40Q6PCS8 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zbtb40Q6PCS8 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zbtb40Q6PCS8 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zbtb40Q6PCS8 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zbtb40Q6PCS8 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms