Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9Q4

Fhod1, FH1/FH2 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fhod1Q6P9Q4 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fhod1Q6P9Q4 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fhod1Q6P9Q4 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fhod1Q6P9Q4 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fhod1Q6P9Q4 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fhod1Q6P9Q4 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fhod1Q6P9Q4 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fhod1Q6P9Q4 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fhod1Q6P9Q4 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fhod1Q6P9Q4 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Fhod1Q6P9Q4 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Fhod1Q6P9Q4 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fhod1Q6P9Q4 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Fhod1Q6P9Q4 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Fhod1Q6P9Q4 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Fhod1Q6P9Q4 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Fhod1Q6P9Q4 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fhod1Q6P9Q4 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fhod1Q6P9Q4 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fhod1Q6P9Q4 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fhod1Q6P9Q4 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fhod1Q6P9Q4 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fhod1Q6P9Q4 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Fhod1Q6P9Q4 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fhod1Q6P9Q4 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fhod1Q6P9Q4 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fhod1Q6P9Q4 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fhod1Q6P9Q4 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fhod1Q6P9Q4 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Fhod1Q6P9Q4 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fhod1Q6P9Q4 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fhod1Q6P9Q4 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fhod1Q6P9Q4 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fhod1Q6P9Q4 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fhod1Q6P9Q4 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fhod1Q6P9Q4 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fhod1Q6P9Q4 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fhod1Q6P9Q4 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fhod1Q6P9Q4 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fhod1Q6P9Q4 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fhod1Q6P9Q4 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fhod1Q6P9Q4 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fhod1Q6P9Q4 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fhod1Q6P9Q4 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fhod1Q6P9Q4 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fhod1Q6P9Q4 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fhod1Q6P9Q4 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fhod1Q6P9Q4 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fhod1Q6P9Q4 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Fhod1Q6P9Q4 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Fhod1Q6P9Q4 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fhod1Q6P9Q4 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fhod1Q6P9Q4 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fhod1Q6P9Q4 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fhod1Q6P9Q4 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fhod1Q6P9Q4 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fhod1Q6P9Q4 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fhod1Q6P9Q4 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fhod1Q6P9Q4 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fhod1Q6P9Q4 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fhod1Q6P9Q4 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fhod1Q6P9Q4 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fhod1Q6P9Q4 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fhod1Q6P9Q4 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fhod1Q6P9Q4 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fhod1Q6P9Q4 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Fhod1Q6P9Q4 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Fhod1Q6P9Q4 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fhod1Q6P9Q4 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fhod1Q6P9Q4 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fhod1Q6P9Q4 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fhod1Q6P9Q4 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Fhod1Q6P9Q4 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fhod1Q6P9Q4 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fhod1Q6P9Q4 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fhod1Q6P9Q4 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fhod1Q6P9Q4 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fhod1Q6P9Q4 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fhod1Q6P9Q4 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Fhod1Q6P9Q4 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fhod1Q6P9Q4 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fhod1Q6P9Q4 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fhod1Q6P9Q4 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fhod1Q6P9Q4 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fhod1Q6P9Q4 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fhod1Q6P9Q4 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fhod1Q6P9Q4 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fhod1Q6P9Q4 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fhod1Q6P9Q4 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fhod1Q6P9Q4 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fhod1Q6P9Q4 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fhod1Q6P9Q4 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fhod1Q6P9Q4 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fhod1Q6P9Q4 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fhod1Q6P9Q4 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fhod1Q6P9Q4 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fhod1Q6P9Q4 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fhod1Q6P9Q4 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Fhod1Q6P9Q4 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fhod1Q6P9Q4 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms