Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF4

Helb, DNA helicase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HelbQ6NVF4 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HelbQ6NVF4 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HelbQ6NVF4 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HelbQ6NVF4 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HelbQ6NVF4 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HelbQ6NVF4 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HelbQ6NVF4 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HelbQ6NVF4 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HelbQ6NVF4 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HelbQ6NVF4 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HelbQ6NVF4 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HelbQ6NVF4 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HelbQ6NVF4 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HelbQ6NVF4 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HelbQ6NVF4 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HelbQ6NVF4 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HelbQ6NVF4 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HelbQ6NVF4 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HelbQ6NVF4 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HelbQ6NVF4 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HelbQ6NVF4 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HelbQ6NVF4 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HelbQ6NVF4 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HelbQ6NVF4 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HelbQ6NVF4 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HelbQ6NVF4 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HelbQ6NVF4 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HelbQ6NVF4 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HelbQ6NVF4 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HelbQ6NVF4 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HelbQ6NVF4 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HelbQ6NVF4 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HelbQ6NVF4 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HelbQ6NVF4 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HelbQ6NVF4 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HelbQ6NVF4 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HelbQ6NVF4 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HelbQ6NVF4 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HelbQ6NVF4 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HelbQ6NVF4 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HelbQ6NVF4 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HelbQ6NVF4 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HelbQ6NVF4 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HelbQ6NVF4 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms