Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms