Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Smarca2Q6DIC0 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Smarca2Q6DIC0 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Smarca2Q6DIC0 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Smarca2Q6DIC0 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Smarca2Q6DIC0 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Smarca2Q6DIC0 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Smarca2Q6DIC0 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Smarca2Q6DIC0 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Smarca2Q6DIC0 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Smarca2Q6DIC0 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Smarca2Q6DIC0 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Smarca2Q6DIC0 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Smarca2Q6DIC0 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Smarca2Q6DIC0 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Smarca2Q6DIC0 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Smarca2Q6DIC0 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Smarca2Q6DIC0 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Smarca2Q6DIC0 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Smarca2Q6DIC0 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Smarca2Q6DIC0 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Smarca2Q6DIC0 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Smarca2Q6DIC0 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Smarca2Q6DIC0 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Smarca2Q6DIC0 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Smarca2Q6DIC0 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Smarca2Q6DIC0 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Smarca2Q6DIC0 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Smarca2Q6DIC0 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Smarca2Q6DIC0 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Smarca2Q6DIC0 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Smarca2Q6DIC0 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Smarca2Q6DIC0 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Smarca2Q6DIC0 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Smarca2Q6DIC0 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Smarca2Q6DIC0 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Smarca2Q6DIC0 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Smarca2Q6DIC0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Smarca2Q6DIC0 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Smarca2Q6DIC0 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Smarca2Q6DIC0 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Smarca2Q6DIC0 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Smarca2Q6DIC0 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Smarca2Q6DIC0 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Smarca2Q6DIC0 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Smarca2Q6DIC0 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Smarca2Q6DIC0 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Smarca2Q6DIC0 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Smarca2Q6DIC0 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Smarca2Q6DIC0 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Smarca2Q6DIC0 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Smarca2Q6DIC0 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Smarca2Q6DIC0 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Smarca2Q6DIC0 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Smarca2Q6DIC0 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Smarca2Q6DIC0 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Smarca2Q6DIC0 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Smarca2Q6DIC0 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smarca2Q6DIC0 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Smarca2Q6DIC0 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smarca2Q6DIC0 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smarca2Q6DIC0 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smarca2Q6DIC0 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smarca2Q6DIC0 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smarca2Q6DIC0 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smarca2Q6DIC0 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smarca2Q6DIC0 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smarca2Q6DIC0 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smarca2Q6DIC0 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smarca2Q6DIC0 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smarca2Q6DIC0 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smarca2Q6DIC0 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smarca2Q6DIC0 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Smarca2Q6DIC0 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smarca2Q6DIC0 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smarca2Q6DIC0 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Smarca2Q6DIC0 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smarca2Q6DIC0 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Smarca2Q6DIC0 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smarca2Q6DIC0 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smarca2Q6DIC0 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Smarca2Q6DIC0 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smarca2Q6DIC0 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smarca2Q6DIC0 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Smarca2Q6DIC0 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Smarca2Q6DIC0 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Smarca2Q6DIC0 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Smarca2Q6DIC0 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Smarca2Q6DIC0 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Smarca2Q6DIC0 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Smarca2Q6DIC0 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Smarca2Q6DIC0 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Smarca2Q6DIC0 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Smarca2Q6DIC0 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Smarca2Q6DIC0 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Smarca2Q6DIC0 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Smarca2Q6DIC0 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Smarca2Q6DIC0 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Smarca2Q6DIC0 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Smarca2Q6DIC0 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms