Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q6DFW0 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q6DFW0 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q6DFW0 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Q6DFW0 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q6DFW0 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Q6DFW0 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Q6DFW0 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q6DFW0 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Q6DFW0 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q6DFW0 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q6DFW0 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q6DFW0 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q6DFW0 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q6DFW0 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q6DFW0 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q6DFW0 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q6DFW0 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q6DFW0 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q6DFW0 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q6DFW0 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q6DFW0 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q6DFW0 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q6DFW0 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q6DFW0 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q6DFW0 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q6DFW0 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q6DFW0 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q6DFW0 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q6DFW0 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Q6DFW0 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Q6DFW0 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Q6DFW0 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Q6DFW0 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Q6DFW0 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Q6DFW0 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q6DFW0 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.05■□□□□ -0
Q6DFW0 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q6DFW0 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Q6DFW0 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q6DFW0 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q6DFW0 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Q6DFW0 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Q6DFW0 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q6DFW0 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q6DFW0 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q6DFW0 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Q6DFW0 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q6DFW0 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q6DFW0 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Q6DFW0 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q6DFW0 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q6DFW0 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q6DFW0 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Q6DFW0 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Q6DFW0 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q6DFW0 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q6DFW0 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q6DFW0 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q6DFW0 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Q6DFW0 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q6DFW0 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q6DFW0 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Q6DFW0 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Q6DFW0 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q6DFW0 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q6DFW0 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Q6DFW0 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Q6DFW0 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q6DFW0 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Q6DFW0 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q6DFW0 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q6DFW0 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q6DFW0 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q6DFW0 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Q6DFW0 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Q6DFW0 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q6DFW0 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Q6DFW0 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Q6DFW0 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Q6DFW0 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q6DFW0 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q6DFW0 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q6DFW0 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q6DFW0 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q6DFW0 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Q6DFW0 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Q6DFW0 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q6DFW0 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q6DFW0 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q6DFW0 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q6DFW0 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q6DFW0 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q6DFW0 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Q6DFW0 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Q6DFW0 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q6DFW0 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q6DFW0 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q6DFW0 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q6DFW0 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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