Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms