Protein–RNA interactions for Protein: Q640N4

Zfp248, Zinc finger protein 248, mousemouse

Predictions only

Length 576 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp248Q640N4 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Zfp248Q640N4 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Zfp248Q640N4 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Zfp248Q640N4 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Zfp248Q640N4 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Zfp248Q640N4 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Zfp248Q640N4 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Zfp248Q640N4 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Zfp248Q640N4 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Zfp248Q640N4 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Zfp248Q640N4 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Zfp248Q640N4 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Zfp248Q640N4 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Zfp248Q640N4 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Zfp248Q640N4 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Zfp248Q640N4 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Zfp248Q640N4 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Zfp248Q640N4 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Zfp248Q640N4 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Zfp248Q640N4 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Zfp248Q640N4 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Zfp248Q640N4 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Zfp248Q640N4 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Zfp248Q640N4 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Zfp248Q640N4 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Zfp248Q640N4 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Zfp248Q640N4 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Zfp248Q640N4 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Zfp248Q640N4 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Zfp248Q640N4 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Zfp248Q640N4 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Zfp248Q640N4 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Zfp248Q640N4 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms