Protein–RNA interactions for Protein: Q62393

Tpd52, Tumor protein D52, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpd52Q62393 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms