Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Ss18Q62280 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Ss18Q62280 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Ss18Q62280 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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