Protein–RNA interactions for Protein: Q62277

Syp, Synaptophysin, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SypQ62277 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SypQ62277 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SypQ62277 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SypQ62277 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SypQ62277 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SypQ62277 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SypQ62277 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SypQ62277 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SypQ62277 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SypQ62277 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SypQ62277 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SypQ62277 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SypQ62277 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SypQ62277 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SypQ62277 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SypQ62277 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SypQ62277 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SypQ62277 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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SypQ62277 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SypQ62277 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SypQ62277 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SypQ62277 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SypQ62277 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SypQ62277 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SypQ62277 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SypQ62277 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SypQ62277 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SypQ62277 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SypQ62277 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SypQ62277 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SypQ62277 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SypQ62277 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SypQ62277 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SypQ62277 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SypQ62277 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SypQ62277 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SypQ62277 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SypQ62277 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SypQ62277 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SypQ62277 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SypQ62277 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SypQ62277 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SypQ62277 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SypQ62277 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SypQ62277 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SypQ62277 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SypQ62277 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SypQ62277 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SypQ62277 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SypQ62277 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SypQ62277 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SypQ62277 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SypQ62277 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SypQ62277 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SypQ62277 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SypQ62277 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SypQ62277 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SypQ62277 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SypQ62277 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SypQ62277 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SypQ62277 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SypQ62277 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SypQ62277 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SypQ62277 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SypQ62277 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SypQ62277 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SypQ62277 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SypQ62277 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SypQ62277 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SypQ62277 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SypQ62277 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SypQ62277 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SypQ62277 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SypQ62277 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SypQ62277 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SypQ62277 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SypQ62277 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SypQ62277 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SypQ62277 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SypQ62277 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SypQ62277 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SypQ62277 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SypQ62277 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SypQ62277 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SypQ62277 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SypQ62277 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SypQ62277 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SypQ62277 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SypQ62277 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SypQ62277 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SypQ62277 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SypQ62277 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SypQ62277 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SypQ62277 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SypQ62277 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SypQ62277 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SypQ62277 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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