Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms