Protein–RNA interactions for Protein: Q62181

Sema3c, Semaphorin-3C, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3cQ62181 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sema3cQ62181 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sema3cQ62181 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sema3cQ62181 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema3cQ62181 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sema3cQ62181 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema3cQ62181 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema3cQ62181 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sema3cQ62181 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema3cQ62181 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Sema3cQ62181 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema3cQ62181 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema3cQ62181 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sema3cQ62181 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema3cQ62181 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema3cQ62181 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema3cQ62181 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema3cQ62181 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sema3cQ62181 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema3cQ62181 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema3cQ62181 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sema3cQ62181 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Sema3cQ62181 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sema3cQ62181 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Sema3cQ62181 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema3cQ62181 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema3cQ62181 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema3cQ62181 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema3cQ62181 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema3cQ62181 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema3cQ62181 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema3cQ62181 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema3cQ62181 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sema3cQ62181 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema3cQ62181 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema3cQ62181 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema3cQ62181 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema3cQ62181 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sema3cQ62181 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Sema3cQ62181 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema3cQ62181 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema3cQ62181 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sema3cQ62181 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Sema3cQ62181 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sema3cQ62181 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sema3cQ62181 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sema3cQ62181 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sema3cQ62181 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sema3cQ62181 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sema3cQ62181 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sema3cQ62181 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sema3cQ62181 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sema3cQ62181 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sema3cQ62181 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sema3cQ62181 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sema3cQ62181 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sema3cQ62181 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Sema3cQ62181 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sema3cQ62181 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sema3cQ62181 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Sema3cQ62181 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sema3cQ62181 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sema3cQ62181 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sema3cQ62181 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sema3cQ62181 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sema3cQ62181 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sema3cQ62181 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sema3cQ62181 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Sema3cQ62181 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sema3cQ62181 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sema3cQ62181 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sema3cQ62181 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sema3cQ62181 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sema3cQ62181 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sema3cQ62181 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sema3cQ62181 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sema3cQ62181 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sema3cQ62181 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sema3cQ62181 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sema3cQ62181 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sema3cQ62181 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sema3cQ62181 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sema3cQ62181 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sema3cQ62181 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sema3cQ62181 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sema3cQ62181 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sema3cQ62181 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sema3cQ62181 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sema3cQ62181 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Sema3cQ62181 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sema3cQ62181 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sema3cQ62181 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sema3cQ62181 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sema3cQ62181 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sema3cQ62181 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sema3cQ62181 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sema3cQ62181 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sema3cQ62181 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sema3cQ62181 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sema3cQ62181 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms