Protein–RNA interactions for Protein: Q61999

Odf1, Outer dense fiber protein 1, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf1Q61999 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Odf1Q61999 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Odf1Q61999 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Odf1Q61999 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Odf1Q61999 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Odf1Q61999 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Odf1Q61999 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Odf1Q61999 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Odf1Q61999 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Odf1Q61999 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Odf1Q61999 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Odf1Q61999 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Odf1Q61999 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Odf1Q61999 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Odf1Q61999 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Odf1Q61999 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Odf1Q61999 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Odf1Q61999 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Odf1Q61999 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Odf1Q61999 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Odf1Q61999 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Odf1Q61999 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Odf1Q61999 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Odf1Q61999 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Odf1Q61999 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Odf1Q61999 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Odf1Q61999 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Odf1Q61999 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Odf1Q61999 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Odf1Q61999 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Odf1Q61999 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Odf1Q61999 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Odf1Q61999 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Odf1Q61999 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Odf1Q61999 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Odf1Q61999 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Odf1Q61999 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Odf1Q61999 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Odf1Q61999 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Odf1Q61999 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Odf1Q61999 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Odf1Q61999 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Odf1Q61999 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Odf1Q61999 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Odf1Q61999 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Odf1Q61999 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Odf1Q61999 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Odf1Q61999 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Odf1Q61999 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Odf1Q61999 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Odf1Q61999 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Odf1Q61999 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Odf1Q61999 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Odf1Q61999 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Odf1Q61999 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Odf1Q61999 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Odf1Q61999 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Odf1Q61999 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Odf1Q61999 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Odf1Q61999 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Odf1Q61999 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Odf1Q61999 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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