Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Itga6Q61739 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Itga6Q61739 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itga6Q61739 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itga6Q61739 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itga6Q61739 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itga6Q61739 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itga6Q61739 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itga6Q61739 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itga6Q61739 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itga6Q61739 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itga6Q61739 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itga6Q61739 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itga6Q61739 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itga6Q61739 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itga6Q61739 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itga6Q61739 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itga6Q61739 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Itga6Q61739 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itga6Q61739 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itga6Q61739 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Itga6Q61739 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itga6Q61739 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itga6Q61739 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Itga6Q61739 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itga6Q61739 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Itga6Q61739 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itga6Q61739 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itga6Q61739 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itga6Q61739 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itga6Q61739 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itga6Q61739 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itga6Q61739 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itga6Q61739 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itga6Q61739 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Itga6Q61739 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itga6Q61739 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itga6Q61739 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itga6Q61739 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itga6Q61739 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Itga6Q61739 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itga6Q61739 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itga6Q61739 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itga6Q61739 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itga6Q61739 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Itga6Q61739 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itga6Q61739 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itga6Q61739 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itga6Q61739 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itga6Q61739 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itga6Q61739 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itga6Q61739 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itga6Q61739 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itga6Q61739 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itga6Q61739 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itga6Q61739 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itga6Q61739 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itga6Q61739 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Itga6Q61739 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Itga6Q61739 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Itga6Q61739 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Itga6Q61739 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Itga6Q61739 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Itga6Q61739 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Itga6Q61739 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Itga6Q61739 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Itga6Q61739 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Itga6Q61739 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Itga6Q61739 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Itga6Q61739 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Itga6Q61739 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Itga6Q61739 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Itga6Q61739 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Itga6Q61739 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Itga6Q61739 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Itga6Q61739 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Itga6Q61739 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Itga6Q61739 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Itga6Q61739 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Itga6Q61739 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Itga6Q61739 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Itga6Q61739 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Itga6Q61739 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Itga6Q61739 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Itga6Q61739 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Itga6Q61739 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Itga6Q61739 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Itga6Q61739 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Itga6Q61739 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Itga6Q61739 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Itga6Q61739 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Itga6Q61739 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Itga6Q61739 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Itga6Q61739 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms