Protein–RNA interactions for Protein: Q61508

Ecm1, Extracellular matrix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm1Q61508 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms