Protein–RNA interactions for Protein: Q61345

Foxd1, Forkhead box protein D1, mousemouse

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Length 456 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd1Q61345 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Foxd1Q61345 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Foxd1Q61345 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Foxd1Q61345 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Foxd1Q61345 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Foxd1Q61345 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Foxd1Q61345 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Foxd1Q61345 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Foxd1Q61345 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Foxd1Q61345 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Foxd1Q61345 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Foxd1Q61345 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Foxd1Q61345 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Foxd1Q61345 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Foxd1Q61345 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Foxd1Q61345 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Foxd1Q61345 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Foxd1Q61345 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Foxd1Q61345 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Foxd1Q61345 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Foxd1Q61345 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Foxd1Q61345 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Foxd1Q61345 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Foxd1Q61345 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Foxd1Q61345 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Foxd1Q61345 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Foxd1Q61345 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Foxd1Q61345 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Foxd1Q61345 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Foxd1Q61345 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Foxd1Q61345 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Foxd1Q61345 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Foxd1Q61345 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Foxd1Q61345 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Foxd1Q61345 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Foxd1Q61345 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Foxd1Q61345 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Foxd1Q61345 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Foxd1Q61345 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Foxd1Q61345 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Foxd1Q61345 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Foxd1Q61345 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Foxd1Q61345 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Foxd1Q61345 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Foxd1Q61345 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Foxd1Q61345 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Foxd1Q61345 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Foxd1Q61345 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Foxd1Q61345 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Foxd1Q61345 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Foxd1Q61345 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Foxd1Q61345 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Foxd1Q61345 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Foxd1Q61345 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Foxd1Q61345 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Foxd1Q61345 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Foxd1Q61345 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Foxd1Q61345 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Foxd1Q61345 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Foxd1Q61345 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Foxd1Q61345 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Foxd1Q61345 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Foxd1Q61345 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Foxd1Q61345 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Foxd1Q61345 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Foxd1Q61345 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Foxd1Q61345 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Foxd1Q61345 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Foxd1Q61345 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Foxd1Q61345 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Foxd1Q61345 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Foxd1Q61345 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Foxd1Q61345 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Foxd1Q61345 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Foxd1Q61345 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Foxd1Q61345 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms