Protein–RNA interactions for Protein: Q61069

Usf1, Upstream stimulatory factor 1, mousemouse

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Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf1Q61069 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usf1Q61069 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Usf1Q61069 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usf1Q61069 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usf1Q61069 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usf1Q61069 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usf1Q61069 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usf1Q61069 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usf1Q61069 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usf1Q61069 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usf1Q61069 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usf1Q61069 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usf1Q61069 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usf1Q61069 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usf1Q61069 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usf1Q61069 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usf1Q61069 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usf1Q61069 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usf1Q61069 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usf1Q61069 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usf1Q61069 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Usf1Q61069 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usf1Q61069 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usf1Q61069 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usf1Q61069 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usf1Q61069 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usf1Q61069 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Usf1Q61069 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Usf1Q61069 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usf1Q61069 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Usf1Q61069 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usf1Q61069 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usf1Q61069 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usf1Q61069 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usf1Q61069 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usf1Q61069 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usf1Q61069 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usf1Q61069 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usf1Q61069 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usf1Q61069 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Usf1Q61069 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usf1Q61069 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usf1Q61069 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usf1Q61069 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usf1Q61069 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usf1Q61069 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usf1Q61069 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usf1Q61069 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usf1Q61069 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usf1Q61069 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usf1Q61069 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usf1Q61069 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usf1Q61069 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usf1Q61069 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Usf1Q61069 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usf1Q61069 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usf1Q61069 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Usf1Q61069 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usf1Q61069 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usf1Q61069 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usf1Q61069 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usf1Q61069 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usf1Q61069 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usf1Q61069 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usf1Q61069 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usf1Q61069 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usf1Q61069 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usf1Q61069 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usf1Q61069 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usf1Q61069 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usf1Q61069 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Usf1Q61069 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usf1Q61069 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usf1Q61069 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usf1Q61069 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Usf1Q61069 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usf1Q61069 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usf1Q61069 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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