Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms