Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Grik1Q60934 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Grik1Q60934 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Grik1Q60934 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Grik1Q60934 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Grik1Q60934 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Grik1Q60934 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Grik1Q60934 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Grik1Q60934 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Grik1Q60934 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Grik1Q60934 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Grik1Q60934 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Grik1Q60934 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Grik1Q60934 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Grik1Q60934 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Grik1Q60934 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Grik1Q60934 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Grik1Q60934 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Grik1Q60934 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Grik1Q60934 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Grik1Q60934 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Grik1Q60934 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Grik1Q60934 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Grik1Q60934 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Grik1Q60934 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grik1Q60934 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grik1Q60934 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grik1Q60934 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grik1Q60934 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms