Protein–RNA interactions for Protein: Q60793

Klf4, Krueppel-like factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf4Q60793 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Klf4Q60793 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Klf4Q60793 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Klf4Q60793 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Klf4Q60793 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Klf4Q60793 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Klf4Q60793 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Klf4Q60793 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Klf4Q60793 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Klf4Q60793 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Klf4Q60793 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Klf4Q60793 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Klf4Q60793 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Klf4Q60793 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Klf4Q60793 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Klf4Q60793 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Klf4Q60793 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Klf4Q60793 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Klf4Q60793 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Klf4Q60793 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Klf4Q60793 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Klf4Q60793 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Klf4Q60793 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Klf4Q60793 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Klf4Q60793 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Klf4Q60793 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Klf4Q60793 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Klf4Q60793 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Klf4Q60793 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Klf4Q60793 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Klf4Q60793 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Klf4Q60793 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Klf4Q60793 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Klf4Q60793 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Klf4Q60793 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Klf4Q60793 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Klf4Q60793 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Klf4Q60793 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Klf4Q60793 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Klf4Q60793 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Klf4Q60793 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Klf4Q60793 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Klf4Q60793 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Klf4Q60793 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Klf4Q60793 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Klf4Q60793 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Klf4Q60793 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Klf4Q60793 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Klf4Q60793 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Klf4Q60793 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Klf4Q60793 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Klf4Q60793 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Klf4Q60793 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Klf4Q60793 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Klf4Q60793 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Klf4Q60793 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
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Klf4Q60793 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Klf4Q60793 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Klf4Q60793 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Klf4Q60793 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Klf4Q60793 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Klf4Q60793 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Klf4Q60793 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Klf4Q60793 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Klf4Q60793 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Klf4Q60793 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Klf4Q60793 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Klf4Q60793 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Klf4Q60793 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Klf4Q60793 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Klf4Q60793 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Klf4Q60793 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Klf4Q60793 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Klf4Q60793 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Klf4Q60793 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Klf4Q60793 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Klf4Q60793 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Klf4Q60793 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Klf4Q60793 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Klf4Q60793 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Klf4Q60793 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Klf4Q60793 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Klf4Q60793 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Klf4Q60793 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Klf4Q60793 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Klf4Q60793 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Klf4Q60793 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Klf4Q60793 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Klf4Q60793 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Klf4Q60793 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Klf4Q60793 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms