Protein–RNA interactions for Protein: Q60722

Tcf4, Transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf4Q60722 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tcf4Q60722 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tcf4Q60722 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tcf4Q60722 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tcf4Q60722 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Tcf4Q60722 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Tcf4Q60722 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tcf4Q60722 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Tcf4Q60722 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Tcf4Q60722 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Tcf4Q60722 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tcf4Q60722 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tcf4Q60722 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tcf4Q60722 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tcf4Q60722 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tcf4Q60722 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tcf4Q60722 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tcf4Q60722 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tcf4Q60722 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Tcf4Q60722 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Tcf4Q60722 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Tcf4Q60722 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tcf4Q60722 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tcf4Q60722 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tcf4Q60722 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tcf4Q60722 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tcf4Q60722 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Tcf4Q60722 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcf4Q60722 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Tcf4Q60722 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Tcf4Q60722 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcf4Q60722 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcf4Q60722 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Tcf4Q60722 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Tcf4Q60722 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcf4Q60722 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcf4Q60722 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcf4Q60722 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Tcf4Q60722 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms