Protein–RNA interactions for Protein: Q60519

Sema5b, Semaphorin-5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema5bQ60519 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema5bQ60519 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema5bQ60519 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema5bQ60519 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema5bQ60519 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema5bQ60519 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema5bQ60519 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema5bQ60519 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema5bQ60519 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema5bQ60519 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema5bQ60519 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema5bQ60519 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema5bQ60519 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema5bQ60519 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema5bQ60519 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema5bQ60519 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema5bQ60519 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sema5bQ60519 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sema5bQ60519 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sema5bQ60519 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sema5bQ60519 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sema5bQ60519 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sema5bQ60519 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sema5bQ60519 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sema5bQ60519 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sema5bQ60519 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sema5bQ60519 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sema5bQ60519 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sema5bQ60519 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sema5bQ60519 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sema5bQ60519 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sema5bQ60519 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema5bQ60519 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema5bQ60519 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema5bQ60519 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema5bQ60519 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema5bQ60519 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema5bQ60519 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema5bQ60519 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema5bQ60519 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema5bQ60519 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema5bQ60519 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema5bQ60519 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema5bQ60519 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema5bQ60519 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema5bQ60519 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema5bQ60519 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema5bQ60519 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema5bQ60519 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema5bQ60519 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema5bQ60519 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema5bQ60519 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema5bQ60519 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema5bQ60519 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema5bQ60519 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema5bQ60519 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema5bQ60519 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema5bQ60519 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema5bQ60519 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema5bQ60519 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema5bQ60519 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema5bQ60519 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema5bQ60519 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema5bQ60519 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema5bQ60519 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema5bQ60519 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema5bQ60519 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema5bQ60519 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema5bQ60519 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema5bQ60519 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema5bQ60519 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema5bQ60519 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema5bQ60519 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema5bQ60519 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema5bQ60519 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema5bQ60519 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema5bQ60519 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema5bQ60519 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema5bQ60519 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema5bQ60519 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema5bQ60519 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema5bQ60519 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema5bQ60519 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema5bQ60519 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema5bQ60519 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema5bQ60519 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema5bQ60519 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema5bQ60519 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema5bQ60519 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema5bQ60519 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema5bQ60519 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema5bQ60519 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema5bQ60519 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema5bQ60519 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema5bQ60519 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema5bQ60519 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema5bQ60519 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema5bQ60519 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema5bQ60519 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema5bQ60519 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.1 ms