Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF89

Atp13a3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a3Q5XF89 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms